Директор Института мировой военной экономики и стратегии факультета мировой экономики и мировой политики НИУ Высшая школа экономики. Начальник Центра военно-спортивной подготовки и патриотического воспитания

Родился 6 апреля 1958 года в городе Ереван, Армянской ССР.

После школы окончил Черноморское высшее военно-морское училище имени Павла Нахимова. Далее обучался в Высших специальных офицерских классы Военно-Морского Флота, Военно-учебном научном центре ВМФ, Военной академии Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации.

Проходил службу на Северном флоте: командиром группы управления зенитно-ракетного дивизиона ракетно-артиллерийской боевой части большого противолодочного корабля «Адмирал Юмашев», командиром зенитно-ракетного дивизиона ракетно-артиллерийской боевой части ракетного крейсера «Адмирал флота Лобов», командиром зенитно-ракетного дивизиона ракетно-артиллерийской боевой части, помощником командира, старшим помощником командира, командиром ракетного крейсера «Маршал Устинов», заместителем командира, начальником штаба и командиром сорок третьей дивизии ракетных кораблей, начальником штаба седьмой оперативной эскадры.

После окончания Военной академии Генерального штаба Вооруженных Сил Российской Федерации Сергей Иосифович назначен на должность начальника штаба Новороссийской военно-морской базы Черноморского флота, но в должность не вступал.
Впоследствии был переназначен на должность командующего Приморской флотилией разнородных сил Тихоокеанского флота.

Указом Президента Российской Федерации от 25 августа 2010 года Сергей Авакянц назначен начальником штаба Тихоокеанского флота.
С 29 октября 2010 года, после утверждения адмирала Константина Сиденко в должности командующего войсками Восточного военного округа, исполнял должность командующего Тихоокеанским флотом.

В должности командующего Тихоокеанским флотом утвержден 3 мая 2012 года.

В апреле 2023 года был уволен в запас, после чего назначен на должность главы штаба, курирующего центры военно-спортивной подготовки и патриотического воспитания.

Воинские звания капитана 2 ранга и капитана 1 ранга присвоены досрочно, воинское звание контр-адмирала присвоено в 2002 году. В середине декабря 2012 года указом Президента России присвоено воинское звание вице-адмирала. Через два года присвоено звание адмирала.

Награды
Орден «За заслуги перед Отечеством» 4-й степени (2021)
Орден Александра Невского (2016)
Орден «За военные заслуги» (1996)
Орден «За морские заслуги» (2.06.2010)
Орден «За службу Родине в Вооружённых Силах СССР» 3-й степени
Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» 2-й степени (23.02.2002)
Медали СССР
Медали РФ
Ведомственные медали РФ
Юбилейная медаль РПЦ «1000-летие преставления святого равноапостольного князя Владимира»